彗星試驗(yàn)(Comet assay), 又稱單細(xì)胞凝膠電泳技術(shù)(Single cell gel electrophoresis, SCGE),是在核酸沉淀法(Nucleoid sedimentation)和暈圈分析(Holo assay)等檢測技術(shù)基礎(chǔ)上逐步發(fā)展起來的一種在單細(xì)胞水平檢測有核細(xì)胞DNA斷裂的新技術(shù)。它主要包括Olive等建立的測定DNA雙鏈斷裂的中性單細(xì)胞凝膠電泳技術(shù)和Singh等建立的測定DNA單鏈斷裂的堿性單細(xì)胞凝膠電泳技術(shù)。此技術(shù)已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于放射生物學(xué)、DNA斷裂與修復(fù)、毒理學(xué)、腫瘤**評價(jià)、細(xì)胞凋亡等領(lǐng)域的研究。
隨著SCGE技術(shù)的發(fā)展,可測量的指標(biāo)也越來越多,而且更準(zhǔn)確。目前,用于SCGE分析的指標(biāo)主要分為四類,包括形狀指標(biāo)、距離指標(biāo)、強(qiáng)度指標(biāo)和矩類指標(biāo)。其中形狀指標(biāo)有彗星細(xì)胞率;距離指標(biāo)包括彗星尾長、彗星全長、彗星頭部半徑、尾部半徑;強(qiáng)度指標(biāo)包括頭部DNA百分含量、尾部DNA百分含量、頭部面積、尾部面積等;矩類指標(biāo)包括尾矩、Olive尾矩等。
新近研發(fā)的彗星分析軟件(Comet Assay Software Project, CASP)是一套僅用分析的獨(dú)立版本軟件,可以對用戶獲得的彗星試驗(yàn)圖片進(jìn)行獨(dú)立分析。該軟件可以在常用電腦上運(yùn)行,界面友好,使用方便,分析速度快,可以一次同時(shí)給出*多達(dá)13個(gè)指標(biāo),分析結(jié)果避免了人為誤差,更加客觀和準(zhǔn)確,結(jié)果可以以.txt文件直接輸出,SPSS等統(tǒng)計(jì)軟件可以直接讀取其輸出結(jié)果,便于統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,是一套非常好的免費(fèi)彗星分析研究軟件。下面我們通過對CASP軟件的安裝及應(yīng)用情況展開CASP免費(fèi)彗星分析軟件的使用介紹。
CASP免費(fèi)彗星分析軟件的使用介紹主要包括兩部分,1、CASP軟件免費(fèi)下載安裝;2、CASP軟件使用詳細(xì)圖解。
CASP軟件免費(fèi)下載安裝:
的工作界面登錄
www.uyczabh.cn網(wǎng)站”資料下載” 單元下載CASP彗星分析軟件(免費(fèi)版)壓縮包,解壓縮后,即可看到CASP彗星分析軟件(免費(fèi)版)應(yīng)用程序,打開即可使用。
CASP軟件使用詳細(xì)圖解:
一、 這是該軟件的工作界面,注意箭頭所指的幾個(gè)按鈕,主要用這幾個(gè)按鈕工作。
二、 單擊紅色箭頭所指按鈕,即打開文件,注意圖像文件應(yīng)是TIF格式,(藍(lán)色圈定所指),按住SHIFT鍵,可以同時(shí)選定多個(gè)文件,點(diǎn)擊OK,(綠色圈定),CASP軟件就讀入了您所選的圖像文件。
三、 點(diǎn)擊view下拉菜單,選紅色箭頭所指的”result window",在分析后您就可以看到您的結(jié)果窗口,綠色箭頭所指是我做的彗星圖像。

四、 下面就可以開始分析了,分析之前*好把右側(cè)的head 和tail選中,(綠色箭頭所指,這樣可以出現(xiàn)頭、尾分明的視覺效果,如圖),在圖像分析框內(nèi)按住左鍵下拉,出現(xiàn)黃色箭頭所指的框,這個(gè)框一定要圈住整個(gè)要分析的一個(gè)彗星圖像,然后就是用到紅色圈定區(qū)域的 按鈕了,我分別做了標(biāo)號,逐一解釋:1和2:可以選前或后面的圖像進(jìn)行分析,即上一個(gè)和下一個(gè)的功能,分析完**個(gè),當(dāng)然要選下一個(gè)分析,很簡單?。?!
3:這是分析的功能鍵,黃色箭頭所指的框圈住彗星后,點(diǎn)擊此按鈕就可以分析了。
4:每分析完一個(gè)彗星后,都要點(diǎn)擊一下它,它會(huì)把結(jié)果數(shù)據(jù)保存到結(jié)果窗口,點(diǎn)擊后,它會(huì)變灰。(這很關(guān)鍵)。
5:背景選擇按鈕,點(diǎn)擊它,框的背景會(huì)上下變化,(注意黃色箭頭所指的框,較小的框是背景框,較大的是工作框,這兩個(gè)框在分析之前是可以調(diào)整的,一般工作框要大于背景框。
6:正式分析前一定要點(diǎn)擊它,否則沒有結(jié)果,如果不點(diǎn)擊它,只是預(yù)分析狀態(tài),在這種狀態(tài)下,可以把分析條件調(diào)好,然后進(jìn)入正式分析,點(diǎn)擊它后,此鈕上會(huì)出現(xiàn)一斜杠。(如圖)。
藍(lán)色箭頭所指區(qū)域是分析后的曲線,主曲線是單峰,如果是雙峰,就是凋亡細(xì)胞。曲線圖下面列舉了幾個(gè)數(shù)據(jù),不全,全部結(jié)果在結(jié)果窗口。(下圖)
五、 分析過程中或分析完成后,都可以看您的 result窗口,如圖,將圖像分析窗口*小化(紅色箭頭),就顯示出結(jié)果窗口(綠色箭頭),從左到右依次是文件名(name)和分析的各個(gè)指標(biāo)。

六、 分析完成后,別忘了輸出結(jié)果,點(diǎn)file下拉菜單,選紅色箭頭所指區(qū)域的“輸出結(jié)果”,將會(huì)出現(xiàn)第七步的圖像。
七、 選輸出結(jié)果后,出現(xiàn)如下的結(jié)果輸出窗口,(黃**域),先建立一個(gè)文件夾用于保存您的結(jié)果文件,也就是給您的結(jié)果安個(gè)窩,呵呵,好了,給您的文件取個(gè)名字吧,別忘了它的擴(kuò)展名是.txt,點(diǎn)擊OK!

八、 找到您保存的結(jié)果文件,我剛才保存的是1.txt,打開看看,結(jié)果好像有點(diǎn)亂,怎么辦?且看下回分解。
九、 沒關(guān)系,把結(jié)果稍微調(diào)整一下就好看了,(要把結(jié)果直接轉(zhuǎn)入SPSS統(tǒng)計(jì)軟件分析,必須做調(diào)整!?。。?。調(diào)整文本框的寬度(綠色箭頭處),把分析的指標(biāo)都放到**行,可是各個(gè)指標(biāo)的英文單詞比較長,簡化一下,如:taillength 變成tl,cometlength變成cl,紅色圈定區(qū),我不再一一贅述。調(diào)整后,左側(cè)就是圖像的name,向右依次是各個(gè)指標(biāo)的數(shù)據(jù),注意?。?!各個(gè)指標(biāo)名和數(shù)據(jù)之間一定要有空格相隔!??!否則無法轉(zhuǎn)入SPSS統(tǒng)計(jì)軟件!

十、 后面的工作就是如何使用SPSS統(tǒng)計(jì)分析了,DXY好像有專門板塊介紹,我就不說了,如有疑問再做解釋。
十一、 附凋亡細(xì)胞分析圖像.jpg